子宫内膜不规则脱落主要是由于黄体萎缩不全导致的。正常情况下，黄体在排卵后9-10天开始萎缩，若黄体萎缩不全，内膜就不能如期完全脱落。
内分泌调节异常因素
下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴功能紊乱： 下丘脑分泌的促性腺激素释放激素（GnRH）以及垂体分泌的促卵泡生成素（FSH）、促黄体生成素（LH）等激素的分泌失调，会影响卵巢黄体的正常发育和萎缩过程。比如，某些女性可能存在FSH和LH的比例失衡，使得黄体不能及时正常萎缩，从而引发子宫内膜不规则脱落。孕激素分泌不足或作用异常： 孕激素能够促使子宫内膜由增生期转化为分泌期，为受精卵着床做准备。如果孕激素分泌量不足，或者子宫内膜对孕激素的反应性出现异常，就会导致子宫内膜不能按正常规律脱落。例如，体内孕激素水平相对偏低，就无法很好地让增厚的子宫内膜有序脱落。
疾病相关因素
妇科疾病影响： 一些妇科疾病会干扰子宫内膜的正常脱落。像子宫内膜炎，炎症刺激会影响子宫内膜的正常生理功能，导致内膜脱落不规则。另外，子宫肌瘤也可能对子宫的正常收缩和内膜脱落产生影响，使得内膜不能顺利、规则地脱落。甲状腺功能异常： 甲状腺分泌的甲状腺素等激素与女性生殖内分泌有着密切联系。当甲状腺功能出现异常时，比如甲状腺功能减退，会影响整个内分泌系统的平衡，进而波及子宫内膜的脱落情况。有研究发现，约一定比例（具体比例可能因研究不同略有差异）的甲状腺功能异常患者会出现子宫内膜不规则脱落的现象。
其他因素
药物影响： 某些药物的使用可能会干扰子宫内膜的脱落过程。比如长期服用避孕药的女性，避孕药中的激素成分可能会影响体内正常的激素平衡，从而导致子宫内膜不规则脱落。还有些女性因其他疾病服用了某些特殊药物，也可能间接影响到子宫内膜的正常状态。生活方式因素： 长期的精神压力过大、过度劳累等生活方式方面的问题，也可能影响内分泌系统，进而影响子宫内膜的脱落。例如，长期处于高压力状态下的女性，内分泌紊乱的概率增加，子宫内膜不规则脱落的风险也可能随之升高。而且，不健康的饮食习惯，如过度节食导致身体营养不均衡，也可能对内分泌产生不良影响，引发子宫内膜不规则脱落。