儿童矮小症的成因较多。据统计，约30% - 50%的矮小症与生长激素缺乏或分泌不足有关。
一、内分泌疾病相关
生长激素缺乏症： 垂体分泌生长激素的功能出现异常，导致生长激素分泌不足，影响骨骼生长和身体发育。例如先天性垂体发育异常等情况可能引发此问题。甲状腺功能减退症： 甲状腺激素分泌不足会使机体代谢减缓，影响儿童的生长发育速度，导致身材矮小，同时还可能伴有智力发育迟缓等表现。
二、遗传因素导致
家族性矮小： 如果父母双方身材偏矮，儿童遗传了父母的矮小基因，就可能出现矮小症。这种情况往往从儿童出生时就有一定的身高基础，且生长速度多在正常范围内，但整体身高低于同年龄、同性别正常儿童的平均水平。染色体异常： 如特纳综合征，常见于女孩，是由于性染色体异常导致，除了身材矮小外，还可能有特殊面容、卵巢发育不全等表现。
三、营养与生活因素影响
营养不良： 长期摄入的营养物质不能满足儿童生长发育的需求，比如蛋白质、钙、维生素等缺乏，会阻碍骨骼的生长和身体的发育。例如一些贫困地区或喂养不当的儿童容易出现这种情况。睡眠不足： 生长激素在夜间睡眠时分泌旺盛，儿童如果长期睡眠不足，会影响生长激素的分泌，进而影响身高增长。一般建议学龄儿童每天保证10 - 12小时的睡眠时间。