孩子睡觉时咳嗽厉害，可能是由感染、过敏性咳嗽、胃食管反流所导致。
一、感染
孩子抵抗力较弱，若受到病毒、细菌、支原体等病原体感染，易引发支气管炎、肺炎、哮喘等疾病。在晚上睡觉时，迷走神经兴奋性会升高，进而引起气道痉挛以及气道分泌物增多，所以夜间咳嗽往往较为严重。比如病毒感染可引起病毒性支气管炎，导致气道炎症和分泌物增加；细菌感染可能引发细菌性肺炎，使肺部出现病变；支原体感染也可能造成支原体肺炎等。
二、过敏性咳嗽
如果孩子属于过敏体质，容易对空气中的某些物质或某些食物过敏，从而引发过敏性咳嗽。夜间时气道会呈现高反应性，对床单上的螨虫以及室内的尘埃等会产生显著的过敏反应，因此夜间咳嗽症状会比较突出，对睡眠质量会产生较大影响。像对尘螨过敏，就容易在夜间接触到床单上的尘螨时引发咳嗽；对某些食物如牛奶、鸡蛋等过敏，若白天食用了这些食物，也可能在夜间出现咳嗽。
三、胃食管反流
孩子的胃肠道功能发育不完善，若饮食不当导致胃肠道负担加重，会造成胃酸分泌过多，进而出现胃食管反流症状。晚上睡觉时处于平卧状态，胃酸反流后刺激咽喉部位，导致咽喉痉挛，从而出现明显的咳嗽。比如孩子暴饮暴食，或食用了不易消化的食物等，都可能引起胃食管反流和夜间咳嗽。
总之，孩子睡觉时咳嗽厉害的原因较多，需仔细分析和判断，必要时采取相应的治疗措施。