月经总是不干净可能由内分泌失调、黄体萎缩不全、子宫肌瘤、子宫内膜息肉、子宫内膜癌等引发。
一、内分泌失调：这主要是由于体内激素分泌紊乱，进而致使月经紊乱，常常表现为月经总是不干净。对此建议进行抽血检查性激素六项。内分泌失调可能是由于多种因素导致的，比如长期精神压力过大、生活作息不规律、过度节食或暴饮暴食等。这些因素可能会影响到下丘脑-垂体-卵巢轴的正常功能，从而导致激素分泌失衡。
二、黄体萎缩不全：因为黄体萎缩不全，会使得月经总是不干净，同时还会伴有月经期延长、月经量增多等情况。此时通常建议做诊断性刮宫。黄体萎缩不全可能与黄体生成素分泌不足、子宫内膜不规则脱落等有关。
三、子宫肌瘤：倘若有子宫肌瘤，且肌瘤生长在黏膜下、肌壁间等部位，就有可能引起月经总是不干净，也会导致月经量增多。这种情况下需要做B超检查来确诊。子宫肌瘤的形成可能与雌激素水平过高、遗传因素等相关。
四、子宫内膜息肉：一旦有子宫内膜息肉，可能会造成子宫内膜不规律脱落，导致月经总不干净。通过B超检查可以明确诊断。子宫内膜息肉的产生可能与炎症刺激、内分泌紊乱等有一定联系。
五、子宫内膜癌：由于癌细胞的浸润，导致子宫内膜脱落增加，容易出现月经量增多、月经总是不干净。对此要进行组织病理检查。子宫内膜癌的发生可能与雌激素长期刺激、遗传因素等有关。
当月经总是不干净时，建议勤换内裤、卫生巾，尤其不建议在出血期间同房，以防引起妇科感染。总之，当出现月经总是不干净的情况时，需要及时就医，明确病因，并采取相应的治疗措施。