系统性红斑狼疮的病因目前尚未完全明确，但研究发现多种因素共同作用可能引发该病。一般认为遗传因素在其中起到重要作用，据统计，有系统性红斑狼疮家族史的人群患病风险比无家族史人群高很多。
遗传因素方面：
基因关联： 研究表明，特定的基因位点与系统性红斑狼疮的发病相关。例如，某些人类白细胞抗原（HLA）基因的变异会增加患病几率。如果家族中有亲属患有系统性红斑狼疮，那么其他家庭成员携带相关易感基因的概率相对较高。遗传易感性传递： 这种疾病不是简单的孟德尔遗传方式，而是多基因参与且受环境因素调节的复杂遗传易感性疾病。父母患病，子女并不是肯定会发病，但发病风险较普通人群明显升高。
环境因素方面：
紫外线照射： 紫外线（如阳光中的紫外线）是诱发系统性红斑狼疮的重要环境因素之一。大约有1/3的系统性红斑狼疮患者在日晒后会病情加重或复发。长期暴露在紫外线下，会使皮肤细胞受损，引发免疫反应异常，从而促进系统性红斑狼疮的发生发展。感染因素： 某些病毒感染可能与系统性红斑狼疮有关。比如EB病毒、C型肝炎病毒等感染后，可能会激活人体的免疫系统，导致自身免疫反应紊乱，进而引发系统性红斑狼疮。有研究发现，在系统性红斑狼疮患者体内，可能存在对这些病毒相关抗原的异常免疫应答。
性激素因素方面：
雌激素影响： 系统性红斑狼疮在女性中的发病率明显高于男性，尤其是在生育年龄的女性。这与雌激素水平密切相关。雌激素可能会刺激免疫系统，改变免疫细胞的功能和活性，从而增加女性患系统性红斑狼疮的风险。例如，青春期女性和育龄期女性相对更容易受到雌激素的影响而发病。雄激素的调节： 雄激素对免疫系统有一定的调节作用，男性体内雄激素水平相对较高，在一定程度上可以抑制免疫系统过度活跃，所以男性患病几率低于女性。但当体内激素平衡被打破时，就可能引发疾病。