月经长时间不干净的原因众多，主要包括以下方面：
一、青春期功血：处于青春期时，由于下丘脑-垂体-卵巢轴尚未完善，其调节功能存在不足，就容易出现月经很久不来一次的情况，或者来了一次月经后会出现淋漓不尽、长时间不干净的现象，此即为青春期功血。
1.青春期功血的形成原因主要就是该轴发育不成熟，导致激素分泌不稳定。
2.具体表现为月经周期的不规律以及月经持续时间的异常。
二、宫颈病变：像慢性宫颈炎或宫颈息肉等宫颈病变，会使月经期出现出血时间延长且不干净、淋漓不尽的症状。
1.慢性宫颈炎可能导致宫颈组织的炎症反应，影响月经的正常排出。
2.宫颈息肉会造成宫颈局部的异常凸起，容易引起出血异常。
三、子宫内膜病变：这是导致月经长时间不干净的关键原因之一。常见的子宫内膜病变有子宫内膜增生和内膜息肉。此类病变通常历时较长，还可能引发子宫内膜的癌前病变，甚至是子宫内膜癌，进而导致月经长时间不干净。
1.子宫内膜增生可能使子宫内膜增厚，影响其正常脱落和修复。
2.内膜息肉会干扰子宫内膜的完整性，导致出血异常。
四、内分泌失调：例如多囊卵巢综合征以及黄体萎缩不全等，均会出现月经长时间不干净的情况。
1.多囊卵巢综合征会引起激素失衡，导致月经紊乱。
2.黄体萎缩不全会使黄体功能异常，影响子宫内膜的脱落。
五、剖宫产手术的女性：由于子宫下段切口愈合不佳，形成凹陷，每个月该部位的子宫内膜脱落不完全，就会出现月经长时间不干净的现象，这种情况被称为子宫憩室。
总之，当出现月经长时间不干净时，需要从宫颈、子宫内膜、内分泌以及有无剖宫产病史等多方面进行综合分析和逐一排查，以准确找出原因并采取合适的治疗措施。