白塞氏病的具体病因目前尚未完全明确，但研究发现可能与遗传因素、感染因素等有关。目前认为遗传因素在白塞氏病的发病中起到一定作用，有研究显示白塞氏病患者中人类白细胞抗原 - B51（HLA - B51）阳性率较高，在某些地区人群中，HLA - B51阳性者患白塞氏病的风险比阴性者高很多。
遗传因素方面
基因关联： 白塞氏病具有一定的遗传易感性，研究表明人类白细胞抗原系统中的HLA - B5、HLA - B51等基因与白塞氏病的发病密切相关。如果家族中有白塞氏病患者，那么其他家族成员患白塞氏病的风险会相对增加。比如在一些有白塞氏病家族聚集现象的家庭中，亲属患病的概率比普通人群要高不少。
感染因素方面
细菌感染： 有研究推测某些细菌感染可能会触发白塞氏病的发病。例如，链球菌、结核杆菌等感染可能与白塞氏病的发生有关。当人体感染了这些细菌后，免疫系统可能会出现异常反应，进而攻击自身组织，引发白塞氏病相关的炎症等病理改变。比如有部分白塞氏病患者在发病前有过结核杆菌感染的经历，经过抗结核治疗后，部分患者的病情有所缓解。病毒感染： 单纯疱疹病毒、巨细胞病毒等病毒感染也被认为可能与白塞氏病的发病相关。病毒感染后可能会影响人体的免疫调节机制，导致免疫系统失衡，从而诱发白塞氏病。不过具体的病毒感染诱发白塞氏病的详细机制还在进一步研究中。
免疫因素方面
免疫系统异常激活： 白塞氏病患者的免疫系统存在异常激活的情况。自身免疫系统会错误地将自身的某些组织当作外来病原体进行攻击，导致血管等组织发生炎症反应。例如，患者体内的T淋巴细胞、B淋巴细胞等免疫细胞功能出现紊乱，会产生过多的炎症因子，如干扰素 - γ、肿瘤坏死因子等，这些炎症因子会引起血管的炎症损伤，进而出现白塞氏病的一系列临床表现，像口腔溃疡、生殖器溃疡、眼部炎症等症状。