白塞氏病的具体病因目前尚未完全明确，但研究认为可能与遗传、感染等因素有关。有研究显示，白塞氏病具有一定的遗传易感性，某些特定基因的携带可能增加患病风险。
遗传因素相关
基因关联： 白塞氏病的发生与人类白细胞抗原（HLA）基因密切相关。例如，HLA-B51基因在白塞氏病患者中的阳性率明显高于正常人群。有数据表明，携带HLA-B51基因的人群患白塞氏病的风险比不携带该基因的人群高很多倍。家族聚集性： 如果家族中有白塞氏病患者，那么其他家族成员患病的几率会相对增加。这提示遗传因素在白塞氏病的发病中起到了重要作用，但并非携带相关基因就一定会发病，只是增加了患病的可能性。
感染因素影响
病毒感染： 有研究推测，某些病毒感染可能会诱发白塞氏病。比如单纯疱疹病毒、巨细胞病毒等感染，可能会通过触发人体的免疫反应，导致自身免疫机制紊乱，进而引发白塞氏病。不过目前对于病毒具体如何引发白塞氏病的详细机制还在进一步研究中。细菌感染： 部分细菌感染也可能与白塞氏病的发生有关。例如链球菌、结核杆菌等感染，可能会作为抗原刺激机体的免疫系统，使免疫系统错误地攻击自身组织，从而导致白塞氏病的发生。像结核杆菌感染，在一些白塞氏病患者中可以检测到结核杆菌相关的抗体或感染迹象。
免疫异常机制
自身免疫反应： 白塞氏病患者存在明显的自身免疫异常。免疫系统会错误地将自身的某些组织当作外来病原体进行攻击，导致血管炎等一系列病理改变。例如，患者体内会产生多种自身抗体，这些抗体参与了血管的炎症损伤过程，使得血管出现红肿、疼痛、功能障碍等表现，进而引发白塞氏病相关的各种症状，如口腔溃疡、生殖器溃疡、眼部炎症等。免疫细胞异常： 患者体内的T淋巴细胞、B淋巴细胞等免疫细胞功能也出现异常。T淋巴细胞的失衡会导致免疫调节紊乱，B淋巴细胞会产生过多的自身抗体，进一步加剧自身免疫反应，促进白塞氏病的病情发展。