功能失调性子宫出血是由于神经内分泌系统失调引起的异常子宫出血，其原因较为复杂。比如，约有30% - 40%的功能失调性子宫出血与下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的功能紊乱有关。
内分泌失调因素
下丘脑 - 垂体功能异常： 当下丘脑分泌的促性腺激素释放激素或垂体分泌的促性腺激素出现失衡时，会影响卵巢的正常排卵和激素分泌。例如，长期精神紧张、压力过大等情况，可能干扰下丘脑 - 垂体的功能，进而引发功能失调性子宫出血。卵巢功能异常： 卵巢排卵障碍是常见原因之一。如果卵泡发育不良，不能正常排卵，就会导致孕激素分泌不足或缺乏。孕激素可以使子宫内膜由增生期转化为分泌期，若缺乏孕激素，子宫内膜持续增生，就容易引起子宫出血。像多囊卵巢综合征患者，往往存在卵巢功能异常，排卵不规律，易出现功能失调性子宫出血。
全身性疾病影响
甲状腺疾病： 甲状腺功能亢进或减退都可能影响月经。甲状腺激素对机体的代谢和内分泌调节起着重要作用，甲状腺功能异常时，会干扰下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴的正常功能，从而导致子宫出血。比如，甲状腺功能亢进患者，可能出现月经周期紊乱、经量异常等情况。血液系统疾病： 某些血液系统疾病会影响凝血功能，进而导致子宫出血异常。例如，血小板减少性紫癜，患者血小板数量减少或功能异常，凝血功能受到影响，容易出现子宫出血不止或经期延长等功能失调性子宫出血的表现。
子宫局部因素
子宫内膜息肉： 子宫内膜局部过度生长形成息肉，会影响子宫内膜的正常收缩和修复。息肉会干扰子宫的正常生理功能，导致子宫出血，而且这种出血往往没有规律，可能表现为经量增多、经期延长等。子宫肌瘤： 尤其是黏膜下子宫肌瘤，会改变子宫内膜的面积和宫腔形态，影响子宫收缩。肌瘤周围的子宫内膜静脉丛充血、扩张，容易引起子宫出血，患者可能出现经量增多、经期延长等症状，进而引发功能失调性子宫出血。