慢性肠胃炎常见的症状有消化系统方面的表现，比如大约有半数以上的患者会出现腹部隐痛，疼痛程度轻重不一，有的是隐隐作痛，有的可能会有胀痛感。还会有消化不良的情况，患者可能会出现食欲减退，进食后有饱胀感，尤其在进食较多或进食不易消化的食物后，这种饱胀感会更明显。
消化系统症状表现
腹痛： 多数患者有腹部隐痛，疼痛部位多在肚脐周围或者上腹部，疼痛没有明显的规律性，可能在进食后加重或者缓解不明显。比如有的患者会感觉肚子时不时地隐隐作痛，持续时间可长可短，短则几分钟，长则数小时。消化不良： 患者常常出现食欲下降，不想吃东西，吃一点就觉得饱了。还可能伴有嗳气、反酸等情况，进食一些油腻食物后，消化不良的症状往往会加重。例如吃了油炸食品后，会觉得肚子胀得难受，还会有反酸水的现象。
全身症状表现
疲劳乏力： 部分慢性肠胃炎患者会有全身乏力的感觉，精神状态欠佳，稍微活动一下就容易感到疲惫。比如原本能轻松爬上三楼，患病后爬一层楼就觉得很累。体重变化： 长期患有慢性肠胃炎的患者，可能会出现体重减轻的情况，如果病情没有得到有效控制，体重会逐渐下降。这是因为肠胃消化吸收功能受到影响，身体摄入的营养物质不能很好地被吸收利用。
肠道功能紊乱表现
腹泻或便秘： 有的患者会出现腹泻，大便次数增多，粪便不成形，可能是稀便或者水样便，一天可能会排便3 - 5次甚至更多。而有的患者则会出现便秘，大便干结，排便困难，几天才排便一次。比如有的患者原本每天排便一次，患病后变成每天排便3 - 4次，而且大便很稀；有的患者则是好几天才解一次大便，大便像羊屎蛋一样。肠道不适： 患者还可能会有腹部胀气的感觉，肚子老是鼓鼓的，有时候会伴有肠鸣音亢进，能听到肚子里咕噜咕噜的响声。