长期缺铁性贫血通常是由铁摄入不足、铁丢失过多或铁利用障碍等原因引起。一般来说，铁摄入不足是常见原因之一，比如婴幼儿在4-6个月后，从母体获得的铁逐渐耗尽，若饮食中没有及时补充足够含铁丰富的食物，就容易发生缺铁性贫血；青少年生长发育快，对铁的需求增加，如果挑食、偏食，也会导致铁摄入不够。
铁摄入不足：
饮食结构不合理： 日常饮食中如果长期缺乏富含铁的食物，像红肉（牛肉、猪肉等）、动物肝脏、豆类等摄入过少，就无法为身体提供足够的铁元素。例如，有的人群几乎不吃红肉，只吃素食，长期下来就容易缺铁。特殊人群铁需求增加： 孕妇在孕期对铁的需求量明显增加，如果没有额外补充足够的铁，就容易出现缺铁性贫血。比如孕妇每天需要的铁量比非孕期要多很多，若不注意补充，就可能发生长期缺铁性贫血。
铁丢失过多：
慢性失血： 慢性胃肠道出血是常见的导致铁丢失过多的原因。像胃溃疡、十二指肠溃疡患者，会有长期少量的胃肠道出血，血液中的铁会随粪便排出体外，长期积累就会引起缺铁性贫血。还有月经过多的女性，每月大量失血也会丢失很多铁，如果不能及时补充，也会造成长期缺铁性贫血。例如，有些女性月经量每次都很多，持续时间长，就容易出现这种情况。其他失血情况： 长期的咯血、血红蛋白尿等也可能导致铁丢失。比如患有肺结核的患者可能会有咯血情况，长期咯血会使铁丢失，进而引发缺铁性贫血。
铁利用障碍：
某些疾病影响： 一些疾病会影响铁的利用，像地中海贫血患者，其体内的血红蛋白合成存在异常，会影响铁的利用，导致铁不能被有效利用来合成血红蛋白，从而引发长期缺铁性贫血。还有慢性炎症性疾病，如类风湿关节炎等，会影响铁在体内的代谢和利用，使得铁不能正常参与血红蛋白的合成，长期发展就可能导致缺铁性贫血。