肛周脓肿主要是由肛腺感染引起的。正常情况下，肛腺分泌的液体可润滑肠道帮助排便，但当肛腺堵塞时，就容易引发感染，进而形成肛周脓肿。据统计，约90%的肛周脓肿是因肛腺感染导致的。
一、肛腺感染相关因素
肛腺堵塞： 粪便干结等情况容易导致肛腺导管堵塞，使得肛腺内分泌物无法正常排出，从而为细菌滋生创造了条件。比如长期便秘的人，粪便过硬容易损伤肛管，进而影响肛腺导管通畅。细菌入侵： 大肠杆菌等肠道细菌容易从堵塞的肛腺侵入周围组织。这些细菌在肛腺内大量繁殖，引发炎症反应，炎症逐渐扩散就可能形成肛周脓肿。
二、自身免疫力因素
免疫力低下人群： 像糖尿病患者，由于血糖控制不佳，身体抵抗力下降，更容易受到细菌感染，包括肛腺部位的感染，从而增加肛周脓肿的发病风险。一般来说，糖尿病患者血糖长期高于正常范围（空腹血糖>7.0mmol/L）时，感染肛周脓肿的几率会明显升高。长期应用免疫抑制剂者： 比如器官移植后需要长期服用免疫抑制剂的患者，他们的免疫系统被抑制，对细菌等病原体的抵御能力减弱，肛腺感染后就较难依靠自身免疫力来控制，容易发展成肛周脓肿。
三、其他局部因素
肛门损伤： 肛门部位受到外伤，如粗暴的肛门检查、异物损伤等，会使肛门周围组织受损，细菌容易通过受损部位侵入，引发感染形成肛周脓肿。例如进行不规范的肛门指检时，用力过猛可能导致肛管直肠黏膜损伤，进而引发感染。肛周皮肤感染： 肛周皮肤发生感染，如毛囊炎等，如果没有得到及时有效的治疗，感染可能蔓延至周围组织，波及肛腺，最终引发肛周脓肿。比如肛周的单个毛囊炎，如果炎症扩散，就可能累及 deeper 组织导致脓肿形成。