毛囊炎的治疗药物需根据病情来选。一般来说，轻症毛囊炎可外用药物治疗，比如2%莫匹罗星软膏，它能抑制细菌生长，帮助缓解炎症。
外用抗生素类药物
莫匹罗星软膏： 适用于革兰阳性球菌引起的皮肤感染，像金黄色葡萄球菌等导致的毛囊炎。它通过干扰细菌蛋白质合成发挥杀菌作用，能有效减轻毛囊部位的红肿、疼痛等症状。夫西地酸乳膏： 对引起毛囊炎的常见细菌也有较好的抗菌活性，可用于治疗脓疱疮、疖肿、毛囊炎等化脓性皮肤感染。它能抑制细菌的蛋白质合成，从而起到杀菌消炎的效果。
抗真菌类药物
酮康唑乳膏： 如果毛囊炎是由真菌感染引起的，比如马拉色菌感染导致的毛囊炎，酮康唑乳膏就比较适用。它可以抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌的生长繁殖。硝酸咪康唑乳膏： 同样用于真菌感染引发的毛囊炎，能抑制真菌的甾醇合成，发挥抗真菌作用，缓解因真菌感染造成的毛囊炎症表现。
其他外用药物
碘酊： 对于轻度的毛囊炎，碘酊有一定的杀菌作用。但使用时要注意，它对皮肤有一定刺激性，不能用于皮肤破损处，使用后可能会有局部皮肤的灼痛等感觉。鱼石脂软膏： 有消肿、消炎、防腐的作用，可用于毛囊炎初期，帮助促进炎症消退。它能使毛囊部位的炎症局限，减轻红肿等症状。另外，对于症状较严重、反复发作的毛囊炎，可能还需要结合口服药物治疗，比如病情严重且外用药物效果不佳时，可能会根据情况口服抗生素等，但具体用药需由医生根据患者的具体病情来决定。同时，在治疗毛囊炎时，还应注意保持皮肤清洁卫生，避免搔抓、摩擦等刺激，以防加重病情。