月经不来且腰疼可能由多种因素导致，包括先兆流产、宫颈管粘连、妇科炎症等。具体如下：
一、先兆流产。发生先兆流产后，患者体内系统会紊乱，特别是内分泌方面，进而引起月经不调致月经推迟。若为宫内孕的患者，其处理如下：
1.保胎治疗，如果想继续妊娠可采取保胎措施；
2.终止妊娠，如果打算放弃此胎，可使用米非司酮片、米索前列醇片来终止妊娠，也可行人工流产负压吸引术。
二、宫颈管粘连。宫颈管粘连会使经血无法顺畅排出体外，表现为月经失调，经血积聚在宫腔可致子宫胀痛，同时伴随月经期盆腔充血会进一步牵拉腰部而出现腰疼。其主要治疗方法是应用宫腔探针及宫颈扩张棒缓慢进行宫颈扩张术。
三、妇科炎症。如宫颈炎、子宫内膜炎等炎症会引发月经不调致月经推迟，同时会使宫颈、子宫内膜等生殖器官组织出现病理性改变而产生疼痛，且会进一步牵拉腰部引起腰疼。对于宫颈炎患者，可服用阿奇霉素、头孢克肟等药物进行治疗；对于子宫内膜炎患者，可服用甲硝唑、多西环素等药物进行治疗。
总之，当出现月经不来且腰疼的情况时，要及时就医，明确具体原因，并根据原因采取相应的治疗措施。