肛周脓肿主要是肛腺感染引起的，约90%的肛周脓肿由肛腺感染导致。肛腺开口在肛窦处，若肛窦被粪便等堵塞，就会引发肛腺感染，感染蔓延后就可能形成肛周脓肿。
肛腺感染相关因素
肛窦损伤： 比如腹泻时频繁刺激肛窦，或者长期便秘导致干硬粪便擦伤肛窦，都容易让细菌侵入肛腺，引发感染。像经常腹泻的人，就比大便正常的人更易出现肛窦损伤进而引发肛周脓肿。肛窦本身特点： 肛窦呈袋状，容易积存粪便和细菌，这就为肛腺感染提供了有利条件。
身体抵抗力因素
免疫力低下人群： 像糖尿病患者，由于血糖控制不佳，身体抵抗力较弱，容易受到细菌侵袭，发生肛周脓肿的风险比正常人高。据统计，糖尿病患者患肛周脓肿的概率是正常人的2 - 3倍。长期熬夜人群： 长期熬夜会打乱人体生物钟，影响免疫系统功能，使身体抵御细菌感染的能力下降，增加肛周脓肿的发病几率。
局部卫生因素
不注意肛周清洁： 平时不经常清洗肛门，会导致肛门周围细菌滋生，容易引发肛腺感染。比如有些不爱干净的人，数天不清洗肛门，就容易出现肛周脓肿问题。穿紧身不透气内裤： 紧身不透气的内裤会使肛门局部温度升高、湿度增大，利于细菌繁殖，增加肛周脓肿的发生风险。