扁桃体肿大通常由多种原因引起，其中最常见的是反复的炎症刺激。比如，儿童时期上呼吸道感染，像扁桃体炎就很容易反复发作，这是导致扁桃体肿大的一个重要因素，据统计，儿童期扁桃体炎反复发作的概率较高。
感染因素引起
病毒感染： 像EB病毒感染，会引发传染性单核细胞增多症，这种情况下扁桃体常常会肿大，同时还可能伴有发热、咽痛等症状。另外，普通的感冒病毒，如鼻病毒等引起的上呼吸道感染，也可能波及扁桃体，导致其肿大。细菌感染： 乙型溶血性链球菌是引发扁桃体炎的常见细菌之一。当人体抵抗力下降时，这种细菌容易侵入扁桃体，引起急性化脓性扁桃体炎，进而导致扁桃体肿大，局部还可能出现化脓的情况。
免疫因素相关
人体的免疫反应也可能参与扁桃体肿大的过程。当扁桃体作为免疫器官接触到外界抗原时，会发生免疫应答反应。如果免疫反应过于强烈，就可能导致扁桃体组织增生，从而出现肿大的情况。例如，自身免疫性疾病可能会影响扁桃体的免疫状态，进而引发扁桃体肿大。
其他因素影响
过敏反应： 当人体接触到过敏原时，如花粉、某些食物等，可能会引起过敏反应，累及扁桃体时也可能导致扁桃体肿大。同时，还可能伴有鼻塞、流涕、打喷嚏等过敏相关症状。邻近器官炎症蔓延： 比如口腔、咽部的炎症，像牙龈炎、咽炎等，如果没有及时治疗，炎症可能蔓延至扁桃体，刺激扁桃体组织，导致其肿大。例如，牙龈炎患者如果口腔卫生状况差，细菌容易扩散，就可能影响到扁桃体。