胃底息肉不一定都需要手术，一般直径小于1厘米的增生性息肉，约有50%会自行消失，暂时不需要手术，但需要定期复查胃镜，观察息肉变化情况。而直径大于2厘米的腺瘤性息肉，发生癌变的风险较高，通常建议手术切除。
息肉性质不同处理有别
增生性息肉：多是炎症刺激引起，多数较小，直径常小于1厘米。如果经检查确定是增生性息肉且无明显症状，可先定期（比如每1~2年）做胃镜随访观察。腺瘤性息肉：属于肿瘤性息肉，有恶变倾向，一旦发现，不管大小，一般建议尽早手术切除，因为它发生癌变的概率相对较高，尤其是直径超过2厘米的腺瘤性息肉。
息肉大小与手术关联
较小息肉：直径在0.5厘米以下的胃底息肉，如果通过检查考虑为良性且无特殊不适，可密切随访，每6~12个月复查胃镜。中等大小息肉：直径在0.5~2厘米之间的胃底息肉，若怀疑有不良病变可能或者有症状，也多建议内镜下切除。较大息肉：直径大于2厘米的胃底息肉，由于癌变风险增加，通常会建议积极手术切除，比如内镜下黏膜切除术（EMR）或内镜下黏膜下层剥离术（ESD）等。
伴随症状影响决策
有明显症状的息肉：如果胃底息肉引起腹痛、腹胀、恶心、呕吐等明显不适症状，即使息肉较小，也可能需要考虑手术切除来缓解症状。无症状但高危的息肉：对于一些虽然没有症状，但属于腺瘤性息肉等高危类型的胃底息肉，即便体积不大，也可能需要尽早手术，以消除潜在的癌变风险。