新生儿黄疸是新生儿期常见的现象，约60%足月儿和80%早产儿会出现生理性黄疸。引起新生儿黄疸的原因主要有以下几方面：
胆红素生成过多
红细胞破坏过多： 新生儿红细胞寿命相对较短，一般为70~90天，而成人红细胞寿命是120天左右，所以新生儿红细胞更新快，破坏多，产生胆红素也就增多。比如胎儿在宫内处于相对低氧环境，红细胞数量代偿性增多，出生后血氧含量增高，过多的红细胞被破坏，胆红素生成增加。血红素加氧酶含量高： 新生儿体内血红素加氧酶含量比成人高，这种酶能使血红素转变为胆红素，使得胆红素生成增多。
肝脏胆红素代谢障碍
肝细胞摄取胆红素能力不足： 新生儿出生时肝细胞内Y、Z蛋白含量低，出生后需要一定时间才逐渐增加，所以在出生后几天内摄取胆红素的能力较弱，导致胆红素在体内堆积。肝细胞结合胆红素功能差： 肝细胞内尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶（UDPGT）活性不足，且活性受多种因素影响，出生后酶的量及活性要到生后1周左右才逐渐正常，所以结合胆红素的能力有限，使得未结合胆红素不能及时转化为结合胆红素排出体外。
胆汁排泄障碍
胆管堵塞： 无论是肝内胆管还是肝外胆管堵塞，都可能引起新生儿胆汁排泄障碍。比如先天性胆道闭锁，就会导致胆红素排泄途径受阻，胆红素在体内积聚，引起黄疸，这种情况多在出生后2周左右出现黄疸并进行性加重。排泄功能缺陷： 有些新生儿存在先天性的胆汁排泄功能缺陷，使得结合胆红素排泄到肠道的过程不顺利，从而导致胆红素在体内潴留，引发黄疸。