茯苓与土茯苓两者科属不同、功效不同、主治不同。
茯苓为多孔菌科卧孔属真菌茯苓的干燥菌核，多于7～9月采挖，挖出后除去泥沙，堆置“发汗”后，摊开晾至表面干燥，再“发汗”，反复数次至现皱纹、内部水分大部散失后，阴干，称为“茯苓个”；或将鲜茯苓按不同部位切制，阴干，分别称为“茯苓块”和“茯苓片”。味甘、淡，性平。归心、肺、脾、肾经。具有利水渗湿，健脾，宁心的功效。用于水肿尿少，痰饮眩悸，脾虚食少，便溏泄泻，心神不安，惊悸失眠。
土茯苓为百合科菝葜属植物光叶菝葜的干燥根茎，全年均可采挖，以秋末冬初采收为佳。味甘、淡，性平。归肝、胃经。具有解毒，除湿，通利关节的功效。用于梅毒及汞中毒所致的肢体拘挛，筋骨疼痛；湿热淋浊，带下，痈肿，瘰疬，疥癣。