肛门里面有小米粒状的小疙瘩，可能是以下原因引起：
1.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染所致，主要通过性接触传播。肛门尖锐湿疣通常表现为肛门内有菜花状、乳头状的赘生物，表面凹凸不平，质地柔软。除了肛门，HPV还可能感染生殖器、口腔等部位。确诊后，可使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物治疗，也可采用激光、冷冻等物理方法去除疣体。此外，患者应注意个人卫生，避免不洁性行为，以预防HPV感染。
2.肛管炎：肛管黏膜的急慢性炎症，可由细菌、病毒、真菌等感染引起。肛门内有小米粒状的小疙瘩，同时伴有肛门疼痛、瘙痒、便血等症状。治疗上，可使用高锰酸钾溶液坐浴，缓解肛门括约肌痉挛，减轻疼痛。同时，还需针对病因进行治疗，如使用抗生素控制感染。
3.直肠息肉：直肠黏膜表面突出的赘生物，可单发或多发，呈米粒至黄豆大小，颜色与周围黏膜相同或略红。除了肛门内有小疙瘩，还可能出现便血、脱垂等症状。较小的息肉可在结肠镜下直接切除，较大的息肉则需手术治疗。
4.其他：肛门里面有小米粒状的小疙瘩，还可能是肛乳头肥大、痔疮、肛管或直肠肿瘤等疾病的表现。
总之，肛门内有小米粒状的小疙瘩可能是多种疾病的症状，建议及时就医，明确诊断，以便采取相应的治疗措施。