肛门里面长小米粒疙瘩，可能是以下原因引起：
1.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染所致，主要通过性接触传播。肛门尖锐湿疣通常表现为肛门内有菜花状、乳头状的赘生物，表面湿润或有出血。除了肛门，HPV还可感染生殖器、口腔等部位。确诊后，可采取激光、冷冻、电灼等物理治疗，或使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物治疗。此外，还需注意个人卫生，避免不洁性行为。
2.肛管炎：肛管黏膜的急慢性炎症，可由细菌、病毒、真菌等感染引起，也可与局部刺激、损伤等有关。主要症状为肛门疼痛、瘙痒、坠胀，有时可伴有黏液脓血便。治疗方法包括温水坐浴、局部外用药物（如痔疮膏）、口服抗生素等。
3.直肠息肉：是直肠黏膜表面突出的赘生物，可单发或多发，通常无明显症状，多在体检时发现。较大的息肉可能会引起便血、脱垂等症状。治疗方法主要为内镜下息肉切除术。
4.其他：肛门里面长小米粒疙瘩还可能是其他肛肠疾病的表现，如内痔、肛乳头肥大、肛周脓肿等。
如果发现肛门里面有小米粒疙瘩，建议及时就医，明确诊断。医生一般会进行肛门指诊、肛门镜等检查，必要时可能会进行病理活检，以确定疙瘩的性质和病因。在未明确诊断之前，应避免自行用药或采取其他治疗措施，以免延误病情。此外，保持肛门清洁、避免搔抓、注意饮食清淡等也有助于缓解症状。