三个月大的宝宝睡觉总左右摇头，可能是由以下原因引起的：
1.正常的生理现象：三个月大的宝宝神经系统尚未发育完全，容易受到外界刺激而出现摇头的现象。这种摇头通常是无意识的，不会影响宝宝的睡眠和生长发育。
2.皮肤瘙痒：如果宝宝头部出汗较多，或者头皮上有湿疹、痱子等，会导致皮肤瘙痒，从而引起宝宝摇头。家长可以检查宝宝的头皮，如有异常，及时处理。
3.缺钙：宝宝缺钙时，会出现多汗、烦躁、睡眠不安等症状，从而引起摇头。家长可以带宝宝去医院检查微量元素，如有缺钙，及时补充钙剂和维生素D。
4.中耳炎：如果宝宝患有中耳炎，会出现耳部疼痛、瘙痒等症状，从而引起摇头。家长可以观察宝宝的耳部，如有异常，及时就医。
5.其他：宝宝在浅睡眠状态时，也会出现摇头、微笑、吸吮等动作，这是正常的生理现象。
总之，如果宝宝睡觉总左右摇头，家长可以先观察宝宝的情况，如果症状持续不缓解或伴有其他异常症状，应及时带宝宝去医院就诊，明确原因后进行针对性治疗。