一、来源与定义方面
黄芪：为豆科植物蒙古黄芪或膜荚黄芪的干燥根，是一个较为宽泛的中药材统称概念。
北芪：其实就是黄芪的一种，主要是指产于北方地区的黄芪，如内蒙古等地所产的黄芪，它是黄芪中较为优质的品种之一，从来源地域角度对黄芪进行了限定。
二、性状方面
黄芪：一般根呈圆柱形，有的有分枝，上端较粗，长30~90cm，直径1~3.5cm。表面淡棕黄色或淡棕褐色，有不整齐的纵皱纹或纵沟。质硬而韧，不易折断，断面纤维性强，并显粉性，皮部黄白色，木部淡黄色，有放射状纹理及裂隙，老根中心偶呈枯朽状，黑褐色或呈空洞。
北芪：北芪在性状上与普通黄芪类似，但通常北芪的根条较为顺直，质地坚实，粉性更足，外观上可能相对更均匀一些，不过这也不是绝对恒定的区分标准，会因具体产地、生长环境等有一定差异。
三、药效方面
相同药效：两者都具有补气升阳、固表止汗、利水消肿、生津养血、行滞通痹、托毒排脓、敛疮生肌等功效。例如在治疗脾胃气虚、倦怠乏力、食少便溏等病症上，黄芪和北芪都可以发挥作用；在表虚自汗方面，都能起到固表止汗的效果。有研究表明，黄芪中的有效成分如黄芪多糖等，具有调节机体免疫功能、增强机体抵抗力等作用，北芪由于产地等因素可能在某些有效成分含量上有一定特点，但整体的药效作用范畴与普通黄芪是一致的，都能通过调节机体的多个系统来发挥相应的治疗和保健功效。
细微差异：由于北芪特定产地的土壤、气候等环境因素影响，可能在某些活性成分含量上略有不同，从而在具体应用时，可能在针对某些特定病症的细微疗效表现上有极少量差异，但总体差异不大，在临床应用中一般可以相互替代使用。
四、适用人群与禁忌方面
适用人群：一般来说，黄芪和北芪适合气虚体质的人群，比如经常感觉疲倦乏力、气短、容易出虚汗等表现的人。对于患有慢性疾病，如慢性支气管炎、慢性肾炎等属于气虚类型的患者也较为适用。不同年龄段均可根据具体病情在医生指导下合理应用，但儿童等特殊人群应用时需格外谨慎，需严格遵循医嘱。
禁忌方面：两者都不宜在表实邪盛、内有积滞、阴虚阳亢等情况下服用。比如体内有湿热、热毒炽盛的人，表现为发热、烦躁、大便秘结、舌苔黄腻等情况时不宜使用；对于孕妇等特殊人群，也需要在医生评估后谨慎应用，因为黄芪有一定的补气作用，不当使用可能会对孕妇及胎儿产生不良影响。同时，不同个体对黄芪和北芪的耐受程度不同，在应用过程中要密切观察身体反应，如有不适及时就医。