女孩来月经时腰痛和肚子疼，可能是以下原因引起：
1.前列腺素水平升高：月经时子宫内膜前列腺素含量升高，可能引起子宫平滑肌过强收缩，血管挛缩，造成子宫缺血、乏氧状态而出现痛经。此外，还可能刺激胃肠道，引起胃肠道平滑肌收缩，出现恶心、呕吐等胃肠道症状。
2.精神、神经因素：部分女孩对疼痛过分敏感，精神、神经因素也会影响痛阈，导致痛经。
3.其他：原发性痛经可能与青春期中枢对激素的正反馈调节机制不完善有关。此外，痛经常常发生在有排卵性月经。
对于月经时腰痛和肚子疼的情况，可以采取以下措施缓解：
1.注意保暖：尤其是腰腹部，避免着凉。
2.注意休息：避免过度劳累和剧烈运动。
3.调整饮食：避免食用生冷、辛辣等刺激性食物。
4.心理调节：保持心情愉悦，避免紧张、焦虑等不良情绪。
5.药物治疗：如果疼痛严重，可以在医生的指导下使用止痛药，如布洛芬、对乙酰氨基酚等。
如果女孩的痛经症状严重，或伴有其他异常症状，如月经量过多、月经周期紊乱等，建议及时就医，进行详细的检查和治疗。此外，如果女孩有性生活，还需要排除怀孕、子宫内膜异位症等疾病的可能。