三个月宝宝睡觉老是摇头，可能是正常的生理现象，也可能与疾病有关。以下是一些可能的原因和处理方法：
1.正常的生理现象：
神经系统发育不完善：宝宝的神经系统还没有完全发育成熟，睡觉时可能会出现不自主的摇头、手抖等动作。这是正常的生理现象，随着宝宝的成长，这种情况会逐渐消失。
出汗：宝宝的新陈代谢比成人快，容易出汗。如果宝宝睡觉时出汗过多，可能会感到不舒服，从而通过摇头来缓解。家长可以注意保持宝宝的皮肤清洁和干燥，适当调整室温，避免给宝宝穿过多的衣服。
环境因素：宝宝对环境的适应能力还比较弱，如果睡眠环境过于嘈杂、闷热或不舒适，可能会影响宝宝的睡眠质量，导致摇头。家长可以为宝宝创造一个安静、舒适、温暖的睡眠环境。
2.与疾病有关的情况：
湿疹：如果宝宝患有湿疹，皮肤会瘙痒，可能会通过摇头来摩擦缓解。家长可以注意观察宝宝的皮肤状况，如果有湿疹，可以咨询医生使用适当的湿疹药膏。
中耳炎：中耳炎是儿童常见的疾病之一，宝宝可能会因为耳部不适而摇头。此外，还可能伴有哭闹、发热等症状。如果怀疑宝宝有中耳炎，应及时带宝宝就医，进行相关检查和治疗。
维生素D缺乏性佝偻病：维生素D缺乏性佝偻病的宝宝会出现多汗、夜惊、烦躁不安等症状，也可能会表现为摇头。家长可以带宝宝去医院检查维生素D水平，如果缺乏，应及时补充。
其他：其他可能导致宝宝睡觉摇头的疾病还包括外耳道炎、皮肤感染等。
如果宝宝除了摇头，还伴有其他异常症状，如哭闹、呕吐、发热等，或者摇头的情况持续不缓解，建议及时带宝宝就医，进行详细的检查和诊断，以确定具体原因并采取相应的治疗措施。
此外，家长在日常生活中可以注意以下几点，有助于提高宝宝的睡眠质量：
建立良好的睡眠习惯：保持宝宝的睡眠时间规律，创造安静、舒适的睡眠环境，避免过度刺激。
注意饮食：宝宝的饮食对睡眠也有一定的影响，保证宝宝摄入足够的营养，避免过度饥饿或饱腹。
适当安抚：在宝宝睡觉前，可以给予适当的安抚，如轻拍、拥抱等，让宝宝感到安全和舒适。
每个宝宝的情况都可能不同，如果对宝宝的睡眠问题有任何疑虑，最好咨询医生的意见。医生可以根据宝宝的具体情况进行评估，并提供个性化的建议和指导。同时，家长也要密切观察宝宝的情况，及时发现问题并采取适当的措施。