46岁月经不来两个月，可能是绝经、怀孕、内分泌疾病等原因引起，可采取不同的处理方法。
绝经：46岁处于围绝经期，卵巢功能逐渐下降，可能会出现月经紊乱，甚至绝经。这是正常的生理现象，一般不需要特殊处理。如果出现潮热、盗汗、失眠等症状，可以在医生的指导下使用激素替代治疗，缓解不适症状。
怀孕：如果有性生活，月经不来需要排除怀孕的可能。可以用验孕棒或早孕试纸自测，也可以去医院抽血检查人绒毛膜促性腺激素（hCG），以明确是否怀孕。
内分泌疾病：如多囊卵巢综合征、高泌乳素血症、甲状腺功能减退等，也可能导致月经不来。此外，长期的精神压力、过度节食、剧烈运动等也可能影响月经。
多囊卵巢综合征：除了月经不来，还可能伴有多毛、痤疮、肥胖等症状。可以通过做超声检查、性激素六项检查等明确诊断。治疗方法包括调整生活方式、药物治疗（如避孕药、二甲双胍等）、手术治疗等。
高泌乳素血症：主要表现为月经失调、闭经、溢乳、不孕等。可以通过做血清泌乳素测定、垂体磁共振等检查明确诊断。治疗方法主要是药物治疗，常用的药物有溴隐亭、卡麦角林等。
甲状腺功能减退：可导致月经紊乱、经量增多、经期延长等。可以通过做甲状腺功能检查明确诊断。治疗方法主要是补充甲状腺激素，常用的药物有左甲状腺素钠片。
其他：子宫内膜损伤、宫腔粘连等也可能导致月经不来。
总之，46岁月经不来两个月需要引起重视，建议及时去医院就诊，做相关检查，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。此外，围绝经期女性要保持良好的生活习惯，适当运动，保持心情愉悦，有助于顺利度过围绝经期。