三个月宝宝睡觉老是摇头，可能与以下原因有关。
正常的生理现象：宝宝的前庭功能尚未发育成熟，会出现摇头的现象，这是一种正常的生理反应。随着宝宝的成长，这种现象会逐渐消失。
湿疹：宝宝头部出汗多，会使头部瘙痒，从而出现摇头的现象。此外，湿疹还可能伴有皮肤发红、皮疹等症状。
缺钙：宝宝缺钙时，会导致头部出汗多，刺激头皮，引起瘙痒，从而出现摇头的现象。此外，缺钙还可能伴有夜惊、夜啼、烦躁、骨骼畸形等症状。
头皮感染：如果宝宝的头部受到细菌或真菌感染，会引起头皮炎症，导致瘙痒，从而出现摇头的现象。此外，头皮感染还可能伴有头皮发红、皮疹、脱屑等症状。
其他：宝宝睡觉时过热、过冷、被褥不舒适等，也可能导致宝宝出现摇头的现象。
如果宝宝只是偶尔摇头，没有其他异常表现，家长可以不用担心。如果宝宝经常摇头，或者伴有其他异常表现，家长应及时带宝宝就医，进行相关检查，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。
此外，家长在日常生活中应注意以下几点，有助于缓解宝宝的症状。
保持宝宝头部清洁：经常给宝宝洗头，保持头部清洁干燥，避免细菌或真菌感染。
给宝宝选择舒适的衣物和被褥：选择棉质、透气的衣物和被褥，避免过热或过冷。
给宝宝适当补充维生素D和钙剂：如果宝宝有缺钙的风险，可以在医生的指导下适当补充维生素D和钙剂。
注意观察宝宝的情况：注意观察宝宝的精神状态、饮食、睡眠等情况，如有异常，及时就医。