大便肛门疼、有鲜血可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，多由便秘引起，典型症状为肛门疼痛、便血和便秘。肛门视诊可发现肛裂“三联征”，即肛裂、前哨痔和肛乳头肥大。
2.痔疮：内痔和混合痔可出现便血，通常为鲜红色，表现为便后滴血或喷射状出血。内痔或混合痔发展到一定程度时，可出现内痔脱出，伴有肛门坠胀、疼痛等症状。肛门视诊或直肠指诊有助于诊断。
3.肛管或直肠损伤：肛管或直肠受到外伤，可导致局部皮肤或黏膜破损，引起出血和疼痛。常见原因有肛门指诊、肠镜检查、异物损伤等。
4.直肠息肉：是直肠黏膜表面突出的赘生物，通常无明显症状，多在排便时发现大便带血或便后出血。息肉较大时，可发生脱垂，引起肛门坠胀、腹痛等症状。直肠指诊、结肠镜检查有助于诊断。
5.直肠肿瘤：如直肠癌，可导致大便习惯改变、大便带血、肛门疼痛等症状。中老年人、有直肠癌家族史者等高危人群，应高度警惕直肠癌的可能。直肠指诊、结肠镜检查、病理活检有助于诊断。
6.其他：溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠结核等肠道疾病，肛管或直肠的血管病变（如血管瘤、血管畸形等），白血病、血小板减少性紫癜等全身性疾病，也可引起大便肛门疼、有鲜血。
总之，大便肛门疼、有鲜血的原因较多，可能是良性疾病，也可能是恶性疾病。出现该症状时，应及时就医，进行相关检查，如肛门指诊、结肠镜检查等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，保持良好的生活习惯，如规律饮食、适量运动、预防便秘等，有助于减少肛肠疾病的发生。