三个月的婴儿睡觉老摇头晃脑，可能是正常的生理现象，也可能与一些疾病有关。以下是一些可能的原因：
1.正常的生理现象：
神经系统发育不完善：三个月的婴儿神经系统还没有完全发育成熟，大脑对肌肉的控制能力还比较弱，可能会出现摇头晃脑、四肢舞动等现象，这是正常的生理反应。
出汗多：婴儿的新陈代谢比较旺盛，容易出汗，如果头部出汗多，会感到不舒服，从而通过摇头晃脑来缓解。
环境因素：如果睡眠环境温度过高、过低，或者枕头不合适，也可能会影响婴儿的睡眠，导致摇头晃脑。
2.与疾病有关的原因：
湿疹：如果婴儿头部有湿疹，会感到瘙痒，从而通过摇头晃脑来缓解。
中耳炎：中耳炎是婴儿常见的疾病，如果中耳内有积液，会刺激鼓膜，导致婴儿出现摇头、哭闹等症状。
维生素D缺乏性佝偻病：维生素D缺乏性佝偻病的婴儿会出现多汗、夜惊、烦躁不安等症状，也可能会出现摇头晃脑的现象。
其他：婴儿如果有外耳道炎、皮肤感染等疾病，也可能会出现摇头晃脑的现象。
需要注意的是，如果婴儿睡觉老摇头晃脑的同时，还伴有哭闹、烦躁、睡眠不安等症状，或者症状持续时间较长，建议及时就医，排除疾病的可能。同时，家长要注意保持婴儿的头部清洁、干燥，选择合适的枕头，营造舒适的睡眠环境。