晨起咳嗽厉害的原因可能有以下几点：
夜间分泌物积聚：夜间睡眠时，呼吸道分泌物会积聚在喉咙和气管中，晨起时体位改变，会刺激咳嗽感受器，引起咳嗽反射，咳出积聚的分泌物。
过敏反应：如果对室内的尘螨、花粉、宠物毛发等过敏，晨起时可能会因接触过敏原而引起咳嗽。
气道炎症：患有慢性气道炎症，如慢性支气管炎、肺气肿等，晨起时咳嗽可能会加重。
胃食管反流病：胃酸反流刺激食管和喉部，也可能导致晨起咳嗽。
其他原因：如鼻中隔偏曲、鼻后滴流综合征、咳嗽变异性哮喘等。
如果晨起咳嗽厉害的症状持续时间较长或伴有其他不适，建议及时就医，进行相关检查，如血常规、胸片、肺功能等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。同时，保持室内空气湿润、戒烟、避免接触过敏原等也有助于缓解咳嗽症状。
对于儿童、老年人、孕妇等特殊人群，如果出现晨起咳嗽厉害的症状，应更加重视，及时就医，以免延误病情。此外，在就医过程中，应如实告知医生自己的症状、病史和用药情况，以便医生做出准确的诊断和治疗。