月经干净三天同房是否会怀孕，取决于女性的月经周期、经期长短以及排卵时间。一般来说，月经干净三天属于安全期，怀孕的几率较小，但也不能完全排除怀孕的可能。
以下是关于这个问题的具体分析：
1.安全期的计算：安全期是指女性月经周期中不容易受孕的时间段。一般来说，安全期包括月经期和月经干净后的几天。然而，安全期的计算并不是绝对准确的，因为女性的排卵时间可能会受到多种因素的影响而发生变化。
2.排卵时间的影响因素：女性的排卵时间通常在下次月经来潮前的14天左右，但这只是一个大致的时间范围。排卵时间可能会受到情绪、压力、环境变化、健康状况等因素的影响而提前或推迟。
3.精子在女性体内的存活时间：精子在女性体内可以存活数天，甚至长达5天。因此，如果在排卵前有精子进入女性体内，它们仍然有可能在女性体内等待卵子的出现并导致受孕。
4.月经周期和经期长短：每个女性的月经周期和经期长短都可能有所不同。如果月经周期较短或经期较长，那么月经干净三天可能已经接近排卵时间，增加了怀孕的风险。
5.个体差异：每个人的身体状况和生理机制都有所不同。有些女性可能排卵较早，而有些女性可能排卵较晚。因此，即使月经周期规律，也不能完全排除在月经干净三天怀孕的可能性。
需要注意的是，安全期避孕法并不是一种可靠的避孕方法，因为它不能准确预测排卵时间。如果没有怀孕的计划，建议采取其他有效的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药、宫内节育器等。
对于特殊人群，如月经不规律、有多囊卵巢综合征等疾病的女性，排卵时间可能更加难以预测，怀孕的风险也相应增加。在这种情况下，建议咨询医生或专业的生殖健康专家，了解更适合自己的避孕方法和生育计划。
总之，月经干净三天同房怀孕的几率较小，但不能完全排除怀孕的可能。如果对怀孕的风险有疑虑或担忧，建议咨询医生或采取更可靠的避孕措施。此外，保持良好的生活习惯、注意身体健康和情绪稳定，也有助于维持生殖系统的正常功能和生育能力。