月经干净三天同房一般不会怀孕，但也不是绝对的。
首先，女性的排卵日期一般在下次月经来潮前的14天左右。卵子自卵巢排出后在输卵管内能生存1～2天，以等待受精；男子的精子在女子的生殖道内可维持2～3天受精能力，故在卵子排出的前后几天里性交容易受孕。月经刚干净的时候，通常还没有排卵，所以同房怀孕的几率比较小。
其次，每个人的月经周期和排卵时间都可能有所不同，而且排卵还可能受到情绪、环境等因素的影响而提前或推迟。此外，精子在女性体内也可能存活一段时间，等待卵子的排出。
因此，虽然月经干净三天同房怀孕的可能性较小，但并不能完全排除怀孕的可能。如果没有怀孕的计划，建议在同房时采取可靠的避孕措施，如使用避孕套、口服避孕药等，以避免意外怀孕。
对于一些月经不规律或排卵异常的女性来说，安全期避孕法并不十分可靠，因为很难准确预测排卵时间。此外，即使在安全期内，精子也可能提前进入女性体内并等待卵子的排出，从而导致怀孕。
对于那些想要怀孕的夫妇来说，可以通过测量基础体温、使用排卵试纸或进行超声监测等方法来确定排卵时间，从而提高受孕的几率。
总之，月经干净三天同房怀孕的几率较小，但不能完全排除怀孕的可能。为了避免意外怀孕，建议在同房时采取可靠的避孕措施。如果对避孕或怀孕有任何疑问，最好咨询医生或专业的医疗机构。同时，无论是否处于安全期，都应该注意个人卫生，避免感染和其他妇科问题的发生。
以上内容仅供参考，具体情况请咨询专业医生。