肛瘘是肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，由内口、瘘管、外口三部分组成。其病因主要与以下因素有关。
1.感染
肛管直肠周围脓肿破溃或切开引流后，形成肛瘘。
2.直肠肛门损伤
外伤、吞咽骨头、金属，肛门体温计，肛门镜检查等损伤肛管直肠，细菌侵入伤口即可引起肛周脓肿，不及时治疗，都可导致肛瘘。
3.肛裂
肛裂反复感染也可并发皮下瘘。
4.会阴部手术
内痔注射误入肌层或手术后感染，产后会阴缝合后感染，前列腺、尿道手术后感染均可引起肛瘘。
5.结核
溃疡性结肠炎、克罗恩病等特异性炎症、结核病等也可引发肛瘘。
肛瘘不能自愈，不及时治疗，会反复发作直肠肛管周围脓肿，因此，一旦确诊肛瘘，需要及时手术治疗。手术治疗原则是将瘘管切开，形成敞开的创面，促使愈合。手术方式很多，手术应根据内口位置的高低、瘘管与肛门括约肌的关系来选择。