大便出血肛门疼的原因可能有以下几点：
1.肛裂：肛裂是肛管皮肤全层裂伤后形成的感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、出血、便秘。引起肛裂的原因主要是由于大便异常，干结的大便通过肛管时，会撑开肛管皮肤，形成小溃疡，引起肛门疼痛、出血。
2.内痔：内痔是肛垫的支持结构、血管丛及动静脉吻合发生病理性改变或移位，内痔一般无疼痛，当内痔发生血栓及感染时则会出现疼痛。内痔出血是由于排便时粪便擦破隆起的曲张静脉和因排便努力，使得肠道内血管压力升高，而引起出血。
3.外痔：外痔位于齿线以下，是由痔外静脉丛曲张或肛缘皱襞皮肤发炎、肥大、结缔组织增生或血栓瘀滞而形成的肿块。外痔表面盖以皮肤，可以看见或摸到，不能送入肛内，不易出血，以疼痛和有异物感为主要症状。
4.肛管或直肠肿瘤：肛管或直肠的良恶性肿瘤，早期可以无明显症状，随着肿瘤的生长，破溃后可以出现大便带血、肛门疼痛等症状。
5.其他：肛管直肠损伤、溃疡性结肠炎、克罗恩病、肠结核等也可以引起大便出血肛门疼。
总之，引起大便出血肛门疼的原因较多，需要及时就医，明确诊断，以便进行针对性治疗。