药物成分方面
金霉素眼膏主要成分是金霉素，属于四环素类抗生素；红霉素眼膏主要成分是红霉素，属于大环内酯类抗生素。
抗菌谱方面
金霉素眼膏对革兰阳性菌及沙眼衣原体等有较好抗菌作用；红霉素眼膏对革兰阳性菌，如金黄色葡萄球菌、链球菌、肺炎链球菌等有较强的抗菌活性，对部分革兰阴性菌如流感嗜血杆菌等也有一定作用。
适应证方面
金霉素眼膏可用于治疗细菌性结膜炎、麦粒肿及细菌性眼睑炎，也用于治疗沙眼；红霉素眼膏适用于沙眼、结膜炎、角膜炎，也用于预防新生儿淋球菌及沙眼衣原体眼部感染。
不良反应方面
金霉素眼膏可能引起眼部刺激，如灼烧感、红肿等，长期使用可能导致耐药菌过度生长等；红霉素眼膏不良反应较少，偶见眼睛疼痛、视力改变、持续性发红或刺激感等。
特殊人群注意事项
孕妇及哺乳期妇女：两者使用均需谨慎，应在医生指导下权衡利弊使用，因为药物可能通过局部吸收进入体内对胎儿或婴儿产生潜在影响。
儿童：儿童使用时需格外小心，应在成人监护下使用，避免药物进入眼内引起不适等，若儿童有眼部感染等情况，需根据儿童年龄、病情等在医生指导下选择合适药物及确定使用方法。例如低龄儿童使用时要防止药物误触等情况发生，因为儿童眼部发育尚未完全成熟，对药物的耐受等情况与成人不同。