药物成分方面
金霉素眼膏主要成分是金霉素，属于四环素类抗生素。
红霉素眼膏主要成分是红霉素，属于大环内酯类抗生素。
抗菌谱方面
金霉素眼膏对革兰阳性菌及沙眼衣原体等有较好抗菌作用，对革兰阴性菌作用相对较弱。
红霉素眼膏对革兰阳性菌，如金黄色葡萄球菌、链球菌等有较强抗菌活性，对部分革兰阴性菌，如脑膜炎奈瑟菌、流感嗜血杆菌等也有一定作用。
适应证方面
金霉素眼膏可用于治疗细菌性结膜炎、麦粒肿及细菌性眼睑炎，也可用于治疗沙眼。
红霉素眼膏适用于沙眼、结膜炎、角膜炎，也可用于预防新生儿淋球菌及沙眼衣原体眼部感染。
不良反应方面
金霉素眼膏使用后可能出现眼部刺激，如灼烧感，也可能发生过敏反应。
红霉素眼膏不良反应较少，偶见眼睛疼痛、视力改变、持续性发红或刺激感等。
特殊人群注意事项
孕妇及哺乳期妇女：两者使用都需谨慎，应在医生指导下权衡利弊使用。因为药物可能通过局部吸收进入体内，虽然局部用药全身吸收量少，但仍需谨慎对待。
儿童：儿童使用时需格外小心，应在成人监护下使用。由于儿童眼部组织较为娇嫩，用药不当可能带来不良影响，若有眼部不适需在医生指导下选择合适药物及确定使用方法。