肠胃感冒主要是由病毒感染引起的，比如柯萨奇病毒，约占引发肠胃感冒病因的80%左右。
病毒感染是主因
柯萨奇病毒： 这是导致肠胃感冒常见的病毒之一，它会侵袭胃肠道和呼吸道，引发一系列不适症状。该病毒通过飞沫传播或者接触被污染的物品传播。其他病毒： 像埃可病毒等也可能引起肠胃感冒，它们同样会在人体的消化道内繁殖，影响肠胃的正常功能。
免疫力低下易发病
儿童群体： 儿童的免疫系统还未完全发育成熟，相对成年人更容易受到病毒的侵袭。比如3岁以下的儿童，由于免疫系统更脆弱，患肠胃感冒的几率比成年人高很多。老年人： 老年人随着年龄增长，免疫力逐渐下降，身体的各项机能也在衰退，所以也比较容易患上肠胃感冒。
环境因素的影响
气温变化： 当气温突然下降时，人体的呼吸道和胃肠道的抵抗力会降低。例如在季节交替的时候，气温在10~20℃波动时，肠胃感冒的发病几率会明显升高。居住环境不卫生： 如果生活的环境比较脏乱，存在较多的病菌，就容易引发肠胃感冒。比如室内通风不良，病菌容易在空气中滋生，增加感染病毒的风险。