肛周脓肿形成原因主要与肛腺感染、肛门损伤等因素有关。一般来说，肛腺感染是导致肛周脓肿较为常见的原因。
肛腺感染相关因素
肛窦炎引发：肛窦形似口袋，容易积存粪便和细菌，当发生肛窦炎时，细菌就容易侵入肛腺。据临床统计，约有超过60%的肛周脓肿患者是因肛窦炎进一步发展导致肛腺感染而起病。肛窦炎若未得到及时有效的控制，炎症会沿着肛腺蔓延，进而引发肛周间隙的感染，最终形成脓肿。肛腺阻塞：粪便干结等情况可能导致肛腺管阻塞，使肛腺内分泌物引流不畅。一旦分泌物积聚，就为细菌的滋生繁殖提供了有利环境，细菌大量繁殖引发感染，逐步形成肛周脓肿。
肛门损伤相关因素
外伤导致：肛门部位受到外伤，比如异物刺伤、肛门直肠手术操作不当等。如果肛门受到外力撞击、尖锐物体刺伤等，皮肤或黏膜受损后，细菌容易侵入伤口引发感染。有数据显示，因肛门外伤导致肛周脓肿的病例约占10%左右。而在肛门直肠手术中，若操作过程中消毒不严格或损伤组织处理不当，也可能引发局部感染形成脓肿。医源性损伤：一些医疗检查或治疗过程中也可能造成肛门损伤从而引发感染。例如，肠镜检查时若操作粗暴，可能损伤肠道黏膜，细菌从损伤处侵入肛周组织，引发感染形成脓肿。
全身疾病相关因素
糖尿病患者：糖尿病患者由于血糖控制不佳，身体抵抗力相对较低，容易受到细菌感染。高血糖环境有利于细菌生长繁殖，肛周部位的感染就更容易发生且不易控制，从而增加了肛周脓肿的发病风险。研究表明，糖尿病患者发生肛周脓肿的概率比正常人高2~3倍。免疫功能低下者：像艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂的人群等，他们的免疫系统功能受损，对细菌等病原体的抵御能力减弱。当身体受到细菌侵袭时，难以有效地进行免疫防御，肛周部位就容易发生感染形成脓肿。