肛周脓肿主要是由肛腺感染引发的，约90%的肛周脓肿与肛腺感染相关。肛腺开口于肛窦，当肛窦受到损伤，比如粪便干结划伤肛窦，就容易引发肛腺感染，感染向周围蔓延就可能形成肛周脓肿。
肛腺感染相关因素
肛窦损伤： 日常排便时，粪便中的硬物等容易划伤肛窦，据统计，约有70% - 80%的肛周脓肿患者存在不同程度的肛窦损伤情况。比如长期便秘的人，大便干结粗硬，排便时对肛窦的损伤概率就更高。肛腺阻塞： 肛腺分泌的液体如果排出不畅，就会导致肛腺阻塞，进而引发感染。像患有肠炎的患者，肠道炎症可能影响肛腺分泌物的正常排出，增加肛腺阻塞的风险。
身体免疫力因素
免疫力低下人群： 比如糖尿病患者，由于血糖控制不佳，身体免疫力会受到影响，更容易发生肛周脓肿。有研究表明，糖尿病患者发生肛周脓肿的概率比正常人高2 - 3倍。另外，长期服用免疫抑制剂的人，像器官移植后需要长期服用免疫抑制剂来防止排异反应的患者，其身体免疫力下降，也容易患上肛周脓肿。儿童群体： 儿童的免疫系统还在发育阶段，相对较弱，也是肛周脓肿的高发人群之一。比如3 - 10岁的儿童，因为卫生习惯相对较差等因素，更容易出现肛周脓肿问题。
局部卫生因素
肛周清洁不到位： 如果不注意肛周的清洁，粪便等污垢容易堆积在肛周，为细菌滋生创造条件，从而增加肛周脓肿的发病风险。例如有些孩子不经常清洗屁股，就比经常清洗的孩子更易患肛周脓肿。肛门局部疾病影响： 患有痔疮等肛门局部疾病时，肛门周围的组织环境发生改变，容易引发感染导致肛周脓肿。比如痔疮患者如果痔核反复脱出，就会刺激肛周组织，使局部抵抗力下降，增加感染的可能性。