小儿黄疸的病因主要有以下几方面。新生儿出生后2-3天左右容易出现生理性黄疸，这是因为新生儿体内胆红素代谢特点导致的，约50%-60%的足月儿和80%的早产儿会出现生理性黄疸。
一、胆红素生成过多
1. 红细胞增多症： 多见于有宫内窘迫、脐带绕颈等情况的新生儿，红细胞数量较多，破坏后产生的胆红素也就增多。比如一些剖宫产的新生儿，由于出生时肺部未充分扩张，可能会出现红细胞增多，进而引发胆红素生成过多。2. 血管外溶血： 像头颅血肿、皮下血肿、颅内出血等情况，都可能导致血管外的红细胞破坏，释放出胆红素，使得胆红素产生量增加。例如新生儿头部受到产伤，出现头颅血肿，就可能引发这种情况。
二、肝脏胆红素代谢障碍
1. 肝细胞摄取胆红素能力低下： 某些原因会影响肝细胞摄取胆红素的过程，比如早产儿的肝细胞内Y、Z蛋白含量不足，出生后1周内才达到正常水平，所以早产儿更容易出现黄疸。还有一些先天性的疾病，也可能导致肝细胞摄取胆红素的能力下降。2. 肝细胞结合胆红素功能缺陷： 尿苷二磷酸葡萄糖醛酸转移酶（UGT）是参与胆红素结合的重要酶，新生儿出生时该酶活性低下，生后1周左右才逐渐增加，这也是生理性黄疸出现的原因之一。如果是先天性的UGT缺乏，就会导致先天性非溶血性黄疸，如Crigler-Najjar综合征。
三、胆汁排泄障碍
1. 新生儿肝炎： 多由病毒感染引起，如乙型肝炎病毒、巨细胞病毒等。这些病毒感染新生儿的肝脏后，会影响肝细胞的功能和胆汁的排泄，导致胆红素在体内堆积引发黄疸。一般在生后1-3周出现黄疸，可伴有食欲减退、呕吐等表现。2. 先天性胆道闭锁： 这是一种较为严重的疾病，病因尚不明确，可能与胚胎发育异常有关。由于胆道闭锁，胆汁无法正常排出，胆红素反流入血，导致新生儿出现进行性加重的黄疸，大便颜色逐渐变为灰白色。