3个月的婴儿睡觉老是摇头，可能是以下原因引起：1.生理因素：环境温度：如果室内温度过高或过低，或者宝宝睡觉时盖的被子过厚或过薄，都可能导致宝宝感到不适，从而出现摇头的现象
皮肤问题：宝宝的头皮可能会出现湿疹、痱子等皮肤问题，这些问题会导致宝宝头皮瘙痒，从而引起摇头
耳部感染：如果宝宝的耳部受到感染，例如中耳炎，可能会导致耳部疼痛，从而引起摇头。2.神经系统发育不完善：3个月的婴儿神经系统发育还不完善，大脑皮层兴奋性较高，睡眠时可能会出现不自主的摇头、四肢抖动等动作，这是正常的生理现象，随着宝宝的生长发育，这种现象会逐渐消失。3.维生素D缺乏性佝偻病：如果宝宝体内维生素D不足，可能会导致钙吸收不良，从而引起佝偻病。佝偻病的早期表现之一就是多汗，宝宝会因为头部多汗而感到瘙痒，从而出现摇头的现象
4.其他：宝宝睡前过于兴奋、疲劳、饥饿等，也可能导致睡觉摇头。如果宝宝只是偶尔出现睡觉摇头的现象，且没有其他异常表现，家长可以先观察一段时间，看看是否能够自行缓解。如果宝宝睡觉摇头的现象比较频繁，或者同时伴有其他异常表现，例如哭闹、烦躁、夜惊、多汗、枕秃等，家长应该及时带宝宝去医院就诊，以确定是否存在维生素D缺乏性佝偻病等疾病，并在医生的指导下进行治疗。