3个月婴儿睡觉老是摇头，可能是正常的生理现象，也可能是由于环境不适、皮肤问题、维生素D缺乏性佝偻病等原因引起的。
1.正常的生理现象：3个月的婴儿神经系统发育尚未完善，控制能力较差，睡眠时可能会出现摇头、面部抽动、四肢抖动等动作，这是正常的生理现象，随着婴儿的生长发育，这种现象会逐渐减少。
2.环境不适：如果婴儿睡觉的环境温度过高、过低，或者被褥过厚、过硬，都可能导致婴儿感觉不舒服，从而出现摇头的现象。
3.皮肤问题：如果婴儿头部有湿疹、痱子等皮肤问题，会导致瘙痒，从而引起婴儿摇头。
4.维生素D缺乏性佝偻病：维生素D缺乏性佝偻病的主要表现为多汗、夜惊、烦躁不安、摇头等症状，严重时还可能出现颅骨软化、鸡胸、漏斗胸等骨骼畸形。
5.其他：中耳炎、外耳道炎等耳部疾病，也可能导致婴儿出现摇头的症状。
此外，需要注意的是，如果婴儿除了摇头，还伴有哭闹、睡眠不安、夜惊、多汗等症状，或者摇头的情况持续时间较长，建议及时带婴儿就医，以便明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，家长在日常生活中要注意给婴儿营造舒适的睡眠环境，保持婴儿头部清洁，及时修剪婴儿指甲，避免婴儿抓挠头部等。