孢子菌毛囊炎主要由马拉色菌感染引起，治疗药物常用抗真菌药物。一般来说，外用抗真菌药物和口服抗真菌药物都可用于治疗孢子菌毛囊炎。
外用抗真菌药物
酮康唑洗剂：可以抑制马拉色菌的生长繁殖，使用时取适量洗剂涂抹在患处，轻轻揉搓后冲洗干净，每周使用2 - 3次。联苯苄唑乳膏：属于广谱抗真菌药物，能有效抑制马拉色菌。使用时取适量乳膏均匀涂抹于患处，一天1次即可。
口服抗真菌药物
伊曲康唑胶囊：是治疗孢子菌毛囊炎常用的口服药之一。它通过干扰真菌细胞色素P - 450的活性，影响真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用。但需要注意，肝功能不全者要慎用，而且服用伊曲康唑期间要定期监测肝功能。氟康唑胶囊：也可用于孢子菌毛囊炎的治疗。它能抑制真菌细胞膜麦角固醇的合成，影响真菌的代谢。不过，对于有严重基础疾病的患者使用时要谨慎评估。
治疗中的注意事项
保持皮肤清洁：患者要注意保持皮肤的清洁干燥，尽量减少出汗，因为马拉色菌在潮湿环境中容易繁殖。比如每天用温水清洗患处皮肤，但要注意水温不宜过高，以免刺激皮肤。避免搔抓：患病部位要避免搔抓，防止皮肤破损导致感染加重或者引起自身传播。如果搔抓严重，可能会使炎症扩散，不利于病情恢复。饮食方面：患者要注意饮食清淡，少吃辛辣、油腻、甜食等容易诱发马拉色菌繁殖的食物。例如要减少油炸食品、巧克力、蛋糕等的摄入，多吃新鲜的蔬菜和水果，保持饮食均衡。