病毒性软疣主要通过局部治疗来去除，比如医生可能会用镊子将软疣小体挤出，一般操作后就可见效。
局部治疗方法
刮除术： 这是比较常用的方法，医生会用消毒后的刮匙将软疣小体完全刮除，操作相对简单，能直接去除疣体。冷冻治疗： 利用低温使软疣组织坏死脱落。通常冷冻后局部可能会出现水疱，然后逐渐结痂脱落，一般需要几次治疗才能完全去除疣体。
药物辅助治疗
外用药物： 可以使用一些抗病毒的外用药物，如酞丁安乳膏等，涂抹在疣体部位，可能对抑制病毒有一定作用，但单独使用效果可能不如局部治疗直接。不过对于一些不适合进行物理治疗的患者可以考虑。
日常注意事项
避免搔抓： 病毒性软疣具有传染性，搔抓疣体后可能会导致自身接种，使疣体扩散到身体其他部位，所以要尽量避免搔抓。注意个人卫生： 保持皮肤清洁，勤换衣物，尤其是贴身的衣物。不要与他人共用毛巾、浴巾等个人物品，防止传染给他人。增强免疫力： 平时要注意合理饮食，保证充足的睡眠，适当进行体育锻炼，以增强身体的免疫力，有助于身体对抗病毒，促进病情恢复。比如每天保证7 - 8小时的睡眠时间，饮食上多摄入富含维生素和蛋白质的食物，像新鲜的蔬菜水果、牛奶、鸡蛋等。