嘴巴里长溃疡的原因有多种。一般来说，约20% - 30%的口腔溃疡是由遗传因素导致的，比如父母双方都容易长溃疡，子女患溃疡的概率相对较高。
一、局部创伤因素
口腔内咬伤： 比如吃饭时不小心咬到口腔黏膜，就容易形成溃疡，这种情况在咀嚼速度快或者吃饭时注意力不集中的人群中较为常见。假牙摩擦： 如果佩戴不合适的假牙，假牙边缘会反复摩擦口腔黏膜，时间长了也会引发溃疡，尤其是新佩戴假牙的人群，更容易出现这种情况。
二、营养缺乏因素
维生素缺乏： 当人体缺乏维生素B1、B2、B6以及维生素C时，就容易长口腔溃疡。例如，长期偏食、挑食的人，摄入新鲜蔬菜水果较少，就可能导致维生素缺乏从而引发溃疡。一般来说，成年人每天需要摄入维生素B族约1.2 - 1.5毫克，维生素C约100毫克。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也会增加长口腔溃疡的风险。比如，一些素食者由于饮食中锌的摄入不足，就比较容易出现口腔溃疡的情况。
三、免疫系统因素
免疫力下降时： 当人体免疫力低下时，比如感冒发烧、过度疲劳、睡眠不足等情况下，口腔内的潜在病菌就容易活跃起来，从而引发口腔溃疡。例如，连续熬夜加班后，很多人会发现口腔出现了溃疡。一般来说，正常人的免疫力在良好状态下能有效抵御病菌，但当免疫力下降到一定程度时，就容易发病。自身免疫性疾病： 像白塞病等自身免疫性疾病也会表现为反复的口腔溃疡，这类疾病往往还会伴有眼部、生殖器等部位的病变，需要及时就医诊断治疗。