经常单纯疱疹主要是由单纯疱疹病毒（HSV）引起的，其中约90%由单纯疱疹病毒Ⅰ型（HSV-1）导致，10%由单纯疱疹病毒Ⅱ型（HSV-2）引起。当人体抵抗力下降时，潜伏在体内的病毒就会被激活从而引发疱疹发作。
病毒潜伏与激活因素
免疫力低下：当人体长时间处于疲劳状态、患有慢性疾病（如艾滋病等）或者长期使用免疫抑制剂时，身体的免疫力会降低，这时候潜伏在神经节中的单纯疱疹病毒就容易被激活。比如，艾滋病患者由于免疫系统受损，患单纯疱疹的概率比正常人高很多。外伤或紫外线照射：皮肤受到外伤，或者长时间受到紫外线照射，也可能诱发单纯疱疹。例如，皮肤被擦伤、割伤后，皮肤的屏障功能受损，单纯疱疹病毒就有可乘之机侵入并引发疱疹。长时间在太阳下暴晒，皮肤受到紫外线损伤，也可能促使潜伏的病毒活跃起来导致发病。
皮肤屏障与病毒感染
皮肤屏障功能异常：皮肤本身是抵御病毒等病原体的第一道防线，如果皮肤的屏障功能出现问题，比如皮肤干燥、患有湿疹等皮肤疾病时，单纯疱疹病毒更容易侵入皮肤引发感染。像患有特应性皮炎的患者，皮肤屏障功能较差，就比较容易反复出现单纯疱疹。黏膜部位感染：在口腔、生殖器等黏膜部位，单纯疱疹病毒也容易感染。比如，通过与感染者密切接触，如接吻等，就可能导致口腔部位的单纯疱疹病毒感染。而生殖器部位的单纯疱疹往往通过性接触传播，当黏膜部位的防御能力下降时，就容易被单纯疱疹病毒侵袭。
遗传与环境因素影响
遗传易感性：部分人群可能存在遗传上对单纯疱疹病毒的易感性，也就是说，他们的基因使得他们比其他人更容易感染单纯疱疹病毒并经常复发。虽然具体的遗传机制还在研究中，但遗传因素在其中起到一定作用。环境因素刺激：生活中的一些环境因素也会诱发单纯疱疹，比如精神压力过大、过度劳累等。长期处于高压力状态下，人体的内分泌和免疫系统会受到影响，从而增加单纯疱疹的发病几率。