嘴巴长溃疡的原因有多种。一般来说，约20%-30%的口腔溃疡与遗传因素有关，如果家族中有多人经常长溃疡，那么个体患病几率会相对较高。
局部创伤因素
口腔内异物摩擦： 比如牙齿有残根、残冠，或者佩戴不合适的假牙，这些都会不断摩擦口腔黏膜，从而引发溃疡。通常这种情况导致的溃疡，在去除刺激因素后，可能需要1-2周左右逐渐愈合。咬伤口腔黏膜： 吃饭时不小心咬伤口腔内侧黏膜，或者牙齿咬合时经常咬到腮帮子等部位，都会引起溃疡。一般这种创伤性溃疡，若注意避免再次咬伤，保持口腔清洁，10天左右也能自行恢复。
营养不良因素
缺乏维生素： 当身体缺乏维生素B2、维生素B12以及叶酸等维生素时，容易长口腔溃疡。例如，长期吃素的人，如果饮食搭配不合理，就很容易缺乏这些维生素。一般通过补充相应的维生素，多吃富含维生素的食物，像橙子、菠菜、动物肝脏等，大约1-2周溃疡可能会有所改善。微量元素缺乏： 当体内缺锌、铁等微量元素时，也会增加长口腔溃疡的几率。比如一些节食减肥的人，饮食不均衡，就可能出现微量元素缺乏的情况。
免疫系统因素
免疫力下降时易发作： 当人体免疫力低下时，如感冒发烧、过度疲劳、睡眠不足等情况下，身体的免疫系统功能减弱，就容易让潜伏在口腔内的病毒或细菌活跃起来，引发口腔溃疡。比如感冒发烧后，很多人会发现嘴里长了溃疡，一般等身体免疫力恢复，溃疡可能在7-10天左右自愈，但如果免疫力长期低下，溃疡可能会反复发作。自身免疫性疾病关联： 像白塞病等自身免疫性疾病，也会导致口腔溃疡反复发作，这类溃疡往往持续时间较长，可能会达到1个月甚至更久，而且还可能伴有眼部、生殖器等部位的病变。