肛门疼且大便出血的原因有很多，以下是一些可能的原因：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵裂后形成的小溃疡，常引起肛门疼痛和便血。肛裂多发生在肛管后位，也可见于前位。典型的肛裂疼痛具有周期性，即排便时疼痛，便后数分钟疼痛缓解，随后又出现剧烈疼痛，常持续数小时。
2.痔疮：内痔或混合痔均可引起大便出血，通常为鲜红色，表现为便后滴血或喷射状出血。内痔或混合痔发展到一定程度时，可出现肛门肿物脱出。
3.肛管或直肠肿瘤：肛管或直肠的良恶性肿瘤，如直肠癌、肛管癌等，也会导致肛门疼痛和便血。这类肿瘤引起的出血，颜色可呈鲜红色或暗红色，同时可能伴有大便习惯改变、大便形状改变等症状。
4.直肠肛管损伤：如肛门裂伤、肛管或直肠内异物损伤等，可导致肛门疼痛和便血。
5.溃疡性结肠炎：是一种病因尚不十分清楚的直肠和结肠慢性炎症，病变主要限于大肠黏膜与黏膜下层。临床表现为腹泻、黏液脓血便、腹痛等，部分患者可出现肛门疼痛和便血。
6.缺血性肠病：因肠系膜动脉栓塞或血栓形成，导致肠管缺血坏死，也会出现肛门疼痛和便血，多伴有剧烈腹痛、呕吐等症状。
7.其他：如感染性肠炎、肠结核、白塞氏病、克罗恩病等，也可能导致肛门疼痛和便血。
总之，肛门疼且大便出血的原因较为复杂，可能是上述一种或多种疾病引起。如果出现这种症状，应及时就医，进行详细的检查，如肛门指诊、肛门镜检查、结肠镜检查等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。
对于40岁以上、有肛肠疾病家族史、长期便秘或腹泻、大便潜血阳性、黏液脓血便等症状的人群，应特别重视肛门疼且大便出血的情况，及时就医，进行相关检查，以排除恶性肿瘤的可能。同时，在日常生活中，应注意保持肛门局部清洁，避免久坐、久站，保持大便通畅，避免食用辛辣刺激性食物等，有助于预防肛肠疾病的发生。