一、先天性乳糖不耐受
先天性乳糖不耐受是因乳糖酶基因缺陷所致，机体从出生起就缺乏或几乎缺乏乳糖酶，这种情况通常无法自愈，需终身采取无乳糖或低乳糖饮食等特殊饮食管理。
二、继发性乳糖不耐受
多由肠道疾病（如急性肠炎、乳糜泻等）引起肠道黏膜损伤，暂时影响乳糖酶分泌，原发病得到有效治疗后，乳糖酶功能可能逐渐恢复，其自愈时间取决于原发病的治疗效果及肠道修复情况，短则数周（原发病恢复快且肠道修复良好时），长则数月甚至更久（原发病复杂或肠道损伤严重时）。
三、成人型乳糖不耐受
是随年龄增长乳糖酶活性生理性下降导致，一般不会自愈，但个体差异明显。部分人群因饮食中乳糖摄入极少，可能长期无明显不耐受症状；而部分人群即使调整饮食，仍会持续存在乳糖不耐受表现，其持续时间受遗传、日常乳糖摄入量、肠道健康状况等因素影响，有些人可能长期存在，有些人可能在饮食结构改变后症状有所缓解但难完全消除乳糖酶活性低的状态。