一、引发感染风险增加
大姨妈没干净时，女性宫颈口处于相对开放状态，此时同房容易使外界细菌等病原体侵入阴道、子宫颈甚至子宫、输卵管等部位。例如，相关研究表明，经期同房导致盆腔炎的发生率明显升高，盆腔炎会引起下腹部疼痛、阴道分泌物增多等症状，严重时可能影响生殖系统功能，对女性的生育等造成长期影响。对于有性生活史的女性，尤其是本身生殖系统较为敏感或有既往妇科炎症病史的人群，这种感染风险会更高。
二、导致月经紊乱
大姨妈没干净就同房，会对子宫的收缩产生影响。子宫收缩异常可能打乱原本的月经周期，引起月经量增多、经期延长等情况。因为同房刺激可能干扰子宫内膜的正常修复过程，使得子宫内膜脱落不规则。从内分泌角度来看，也可能影响激素的正常分泌调节，进而导致月经周期出现紊乱。无论是青春期女性由于内分泌调节尚不完善，还是育龄期女性因生活方式等因素影响，都可能受到这种月经紊乱的影响，而且这种影响可能会持续一段时间，需要一定时间来恢复正常的月经节律。
三、增加子宫内膜异位症风险
在月经期间，子宫内膜会有脱落的情况，而同房时的子宫收缩等动作可能会促使子宫内膜组织逆流进入盆腔等部位，从而增加子宫内膜异位症的发生几率。子宫内膜异位症会引起进行性加重的痛经、不孕等问题，严重影响女性的生活质量和生育功能。对于有家族遗传倾向或者本身子宫内膜较活跃的女性，这种风险相对更高，而且一旦患上子宫内膜异位症，治疗相对较为复杂，对身体的影响也较为长远。
四、对男性健康的潜在影响（间接）
虽然主要是对女性健康影响较大，但男性在与经期女性同房后，也可能间接受到影响。比如，女性阴道在经期环境特殊，同房时男性可能接触到含有经血等的分泌物，虽然直接导致男性健康问题的情况相对较少，但从卫生角度考虑，也可能引起男性局部的不适等情况，不过相对女性而言，这种影响程度相对较轻，但也不应忽视，尤其是在性生活卫生方面需要注意。
总之，大姨妈没干净就同房会给女性带来多方面的健康危害，无论是从感染、月经、子宫内膜异位症等方面，不同年龄、生活方式和病史的女性都应重视经期卫生和性生活的合理安排，尽量避免在月经未干净时进行同房行为，以维护自身的生殖健康。